A l’origine elle fut une chapelle, construite par les moines de la Lyre qui occupèrent le vieux château de 1100 à 1568.

Il ne reste de cette époque que les contreforts de la nef du chœur.

L’église fut très remaniée au XVIe et au XVIIIe siècle et a été donnée aux habitants de Baons-le-Comte par les Seigneurs pour remplacer l’église paroissiale qui avait brûlé.

L’édifice est simple et se compose, dans le chœur d’une nef voûtée en bois, recouverte de plâtre, et de la grande nef voûtée avec ses deux petites chapelles édifiées, et en 1854, dédiées à la Vierge Marie et à Saint-Nicolas lequel fut remplacé par Saint-Joseph et la Sainte Famille.